2013年4月6日土曜日

FC2便利だね

アップロード素敵!

http://cogas.web.fc2.com/jacobian.pdf

ヤコビアンについて自分なりに追求してみた、多分穴だらけ

OpenOffice.orgの数式エディタの練習がてら、pdfを書いてみましたが、なかなかいいですね。

2013年4月5日金曜日

したいことリスト(TO DOではない)

WANNA DOリスト…?←

・java Applet
とりあえずアップロードできるようになったし、ボタンとかアニメーションとかをひと通りやりたい。

・細胞の物理生物学を読む
読みたい

・TeX
おいおい役に立ちそうだから今のうちにやっておきたい

・確率過程
読みたいけどまるで進まな~~い


くらいかな?

Java applet倉庫

ようやくjava appletのアップロードの仕方が分かったので(遅い)、
ここに作れたやつは置いていこうかなーみたいな。

タンパク質フォールディング2次元おもちゃ
http://cogas.web.fc2.com/applet/proteinfolding.htm

タンパク質の折りたたみ?

久々にjavaを触ったついでに、タンパク質の2次元なフォールディングおもちゃを作りました。

えっと。
タンパク質といったが、
①ただの丸い玉

②2種類の玉

③電荷が+1か-1かどちらかの玉

④とにかく玉


タンパク質と言ったら怒られそうなレベルのおもちゃですけど・・・ww

アミノ酸残基をランダムで1~80とし、
ランダムでそれぞれの電荷を1か-1で決めていきます。

フォールディングのルールとしては、
・アミノ酸は格子点にあること。
・斜めはダメ(連結したアミノ酸の上下左右のどこかにしか行けない)
・逆自乗則に(というか静電ポテンシャル)が最小となるように頑張ってもらう。

・・・ってな感じにしてみましたわあ。

で、まあこれだけで終わるのも面白くないので、
ひたすらRunしまくって、適当にピックアップして終わろうかな!
プラス電荷が赤色、マイナス電荷が水色でござるよ。












こう見てみると、静電ポテンシャルの安定性だけでは上手くまとまらないのかな?
ずっとみてるとマリオパーティのマップを思い出した←
オリジナルマップにどうでしょうか←